MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium multivorum AIU301 plasmid pACMV7

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015189	AAGCAA	2	12	4	15	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325169047
2	NC_015189	ACC	2	6	25	30	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169047
3	NC_015189	CGG	2	6	36	41	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169047
4	NC_015189	CGC	2	6	63	68	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169047
5	NC_015189	GCC	2	6	112	117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169047
6	NC_015189	TGA	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169047
7	NC_015189	TCA	2	6	128	133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169047
8	NC_015189	TGG	2	6	161	166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169047
9	NC_015189	AG	3	6	218	223	50 %	0 %	50 %	0 %	325169047
10	NC_015189	CGG	2	6	359	364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325169047
11	NC_015189	AAC	2	6	386	391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169047
12	NC_015189	CCCA	2	8	491	498	25 %	0 %	0 %	75 %	325169047
13	NC_015189	GCC	2	6	499	504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169047
14	NC_015189	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169048
15	NC_015189	CCA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169048
16	NC_015189	G	6	6	774	779	0 %	0 %	100 %	0 %	325169048
17	NC_015189	AGG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169048
18	NC_015189	GCT	2	6	892	897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169048
19	NC_015189	CAC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169048
20	NC_015189	CTG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169048
21	NC_015189	GC	3	6	1055	1060	0 %	0 %	50 %	50 %	325169049
22	NC_015189	GAG	2	6	1098	1103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325169049
23	NC_015189	GACT	2	8	1147	1154	25 %	25 %	25 %	25 %	325169049
24	NC_015189	GCA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169049
25	NC_015189	GC	3	6	1320	1325	0 %	0 %	50 %	50 %	325169049
26	NC_015189	ATG	2	6	1398	1403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169049
27	NC_015189	AGA	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169049
28	NC_015189	CCA	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015189	AAT	2	6	1456	1461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325169050
30	NC_015189	CGCC	2	8	1670	1677	0 %	0 %	25 %	75 %	325169050
31	NC_015189	TA	3	6	1683	1688	50 %	50 %	0 %	0 %	325169050
32	NC_015189	AGT	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015189	GCC	2	6	1813	1818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169051
34	NC_015189	GCT	2	6	1831	1836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169051
35	NC_015189	CAA	2	6	1889	1894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169051
36	NC_015189	TCGC	2	8	1914	1921	0 %	25 %	25 %	50 %	325169051
37	NC_015189	CAT	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169051
38	NC_015189	CTGT	2	8	2069	2076	0 %	50 %	25 %	25 %	325169051
39	NC_015189	GCT	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169051
40	NC_015189	CGC	2	6	2151	2156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169051
41	NC_015189	TCA	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169051
42	NC_015189	ACTT	2	8	2270	2277	25 %	50 %	0 %	25 %	325169051
43	NC_015189	TAAA	2	8	2361	2368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015189	CCT	2	6	2466	2471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325169052
45	NC_015189	CGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169052
46	NC_015189	TTGG	2	8	2518	2525	0 %	50 %	50 %	0 %	325169052
47	NC_015189	ACAG	2	8	2537	2544	50 %	0 %	25 %	25 %	325169052
48	NC_015189	CCAG	2	8	2552	2559	25 %	0 %	25 %	50 %	325169052
49	NC_015189	CAGA	2	8	2589	2596	50 %	0 %	25 %	25 %	325169052
50	NC_015189	C	6	6	2661	2666	0 %	0 %	0 %	100 %	325169052
51	NC_015189	CTG	2	6	2677	2682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169052
52	NC_015189	CCTGC	2	10	2707	2716	0 %	20 %	20 %	60 %	325169052
53	NC_015189	CGC	2	6	2733	2738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169052
54	NC_015189	GGTC	2	8	2739	2746	0 %	25 %	50 %	25 %	325169052
55	NC_015189	GCC	3	9	2771	2779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169052
56	NC_015189	GC	3	6	2814	2819	0 %	0 %	50 %	50 %	325169052
57	NC_015189	GC	3	6	2933	2938	0 %	0 %	50 %	50 %	325169052
58	NC_015189	TGG	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325169052
59	NC_015189	TTG	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325169052
60	NC_015189	ATG	2	6	3098	3103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169052
61	NC_015189	CCA	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169052
62	NC_015189	CCG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325169052
63	NC_015189	CAGG	2	8	3335	3342	25 %	0 %	50 %	25 %	325169052
64	NC_015189	AAC	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325169052
65	NC_015189	TCGT	2	8	3419	3426	0 %	50 %	25 %	25 %	325169052
66	NC_015189	TGC	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169052
67	NC_015189	CCA	3	9	3473	3481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325169052
68	NC_015189	CGA	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169052
69	NC_015189	GC	3	6	3590	3595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015189	CAT	2	6	3637	3642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015189	CAG	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169053
72	NC_015189	GAA	2	6	3735	3740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325169053
73	NC_015189	AGC	2	6	3786	3791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169053
74	NC_015189	GCT	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169053
75	NC_015189	CG	3	6	3845	3850	0 %	0 %	50 %	50 %	325169053
76	NC_015189	GTC	2	6	3877	3882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325169053
77	NC_015189	GAT	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325169053
78	NC_015189	GCA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325169053
79	NC_015189	ATC	2	6	3914	3919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325169053
80	NC_015189	TGC	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015189	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015189	CT	3	6	4058	4063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015189	CCG	2	6	4086	4091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015189	CCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_015189	GCAG	2	8	4123	4130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015189	AG	3	6	4145	4150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015189	TGGCTG	2	12	4302	4313	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325169054
88	NC_015189	TGGCA	2	10	4347	4356	20 %	20 %	40 %	20 %	325169054
89	NC_015189	GC	3	6	4399	4404	0 %	0 %	50 %	50 %	325169054
90	NC_015189	GC	3	6	4571	4576	0 %	0 %	50 %	50 %	325169054
91	NC_015189	GCC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015189	GGC	2	6	4642	4647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015189	GCC	2	6	4704	4709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_015189	GGC	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015189	GGATA	2	10	4720	4729	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015189	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_015189	GCC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015189	TCAT	2	8	4801	4808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015189	GCC	2	6	4820	4825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_015189	CCT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_015189	GGCA	2	8	4925	4932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_015189	A	7	7	4975	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015189	TAT	2	6	4983	4988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015189	AT	3	6	4987	4992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015189	AAT	2	6	4994	4999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015189	G	8	8	5006	5013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015189	CCA	2	6	5018	5023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015189	CCA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015189	AAT	2	6	5147	5152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.